部分物资抵达保税区域后，并非一律算作已进口，需要依据特定的规范和程序来判定，
货物是否算作进口要看其出处和用途。若从国外首次运抵中国后进入保税区，该货物并非立即算作进口；而若为了享受出口退税政策，本国产品故意在保税区流转，此类行为也不属于常规进口。当这些物品或物料计划销往中国内地市场时，才会依照标准流程办理进口手续并支付对应费用。
海外商品先运入保税区域，然后转出到境外，保税区库房提供租赁服务，区内货物进出口需要办理报关手续。
国际中转货运：针对境内外的集装箱货物，不论其来源国别或地区，实施迅速的拆解、组合、集中并转运至国内外的不同终点港。此外，能够围绕中转贸易开展相关服务贸易业务，增强港口的综合能力。比如美国购买的润滑油先在保税区进行免税储存，国内采购的包装物料在保税区完成分装、筛选、包装及贴签工作，然后转口至其他国家和地区。
保税仓储功能，允许园区存放除国家明令禁止进出口的物品以外，各类通过不同贸易途径进出口的货物烟台保税区进口商品，以及尚未完成海关手续的货物，这些货物都可以在园区内进行储存。国内企业将出口货物运至保税区后，可以申请退税，并在此进行仓储处理，随后根据购买者的需求，将货物再次运回国内市场，或者出口至其他国家。
进入保税区的各类货物能够持续保存，区内仓库可供公司进行基础性处理烟台保税区进口商品，例如进行物品整理、重新组合、进行包装、实施拣选、加上标识、进行喷码等操作。对于转运以及仓储的物品，其存放时间没有严格限制。
该深圳企业担当韩国某润滑油品牌的中国代理，从韩国购入该品牌润滑油，随后转运至保税仓库储存，因国外货物进入保税区无需缴纳关税，在保税区内将大桶润滑油分装成小桶，完成包装和贴标工作，之后一部分通过一般贸易形式进口至国内市场，另一部分则出口至其他国家进行销售
保税区统一购买，涉及出口包装组合业务，物品包括笔记本配件、鼠标、冷却设备、发声装置以及包装物料。国内A公司把出口鼠标运往保税区，国内B公司把散热器运往保税区，台湾C公司经香港港口送货物到保税区，或者经深圳港口转关进入保税区，在这个过程中，A和B公司运到保税区的货物可以退税或核销，C公司运到保税区的货物免税且可以自由通过海关进入保税区。另处一家包装材料供应商将包装材料运往保税区，针对那些套件开展包装、分选、粘贴标识等基础处理工作。
